Proteinkemi

Mål

Kursen avser att ge fördjupade kunskaper inom följande områden: protein engineering, struktur-funktionssamband, proteiners biofysikalisk-kemiska egenskaper och metodologi för karaktärisering av proteiner.

Efter väl inhämtad kurs kan man:

• identifiera hur proteiner är uppbyggda.
• använda information från olika databaser för att jämföra aminosyrasekvenser och utifrån det göra förutsägelser relaterade till proteinets biofysikaliska egenskaper.
• använda biofysikaliska mätdata för karakterisering av proteiner.

Innehåll

I kursen behandlas olika strukturmotiv hos proteiner som alfadomänstrukturer, alfa/betastrukturer, antiparallella betastrukturer, multifunktionella enzymer, membranproteiner, förutsägelse av proteinstrukturer. Vidare behandlas fysikalisk-kemiska egenskaper hos proteiner och metodik för studier av dessa. Moment som behandlas är kemiska egenskaper hos polypeptider, protein engineering, fysikaliska interaktioner som bestämmer proteiners egenskaper, bl.a. hydrofobinteraktionens roll, proteinstrukturens flexibilitet, proteiners stabilitet, proteinveckningsmekanismer, interaktion med andra molekyler, enzymkatalys.