Genetiska mekanismer bakom komplexa egenskaper

Mål

Målet med kursen är att studenterna ska få fördjupade kunskaper om kvantitativa genetiska tekniker, i synnerhet avseende identifiering av gener som ligger till grund för komplexa egenskaper och sjukdomar.

Kunskap och förståelseEfter avslutad kurs förväntas studenten kunna:

• Beskriva kvantitativa genetiska tekniker, speciellt hur de tillämpas på komplex egenskapsgenetik.
• Förklara den statistiska grunden för kvantitativa egenskaper
• Förklara och särskilja koppling och kopplingsbalans och deras användningsområden.
• Analysera den genetiska arkitekturen av olika beteenden och sjukdomskarakteristika.
• Analysera och identifiera genetiska komponenter hos kvantitativa egenskaper.

Färdighet och förmågaEfter avslutad kurs förväntas studenten kunna:

• Applicera tekniker för kvantitativ genetik på verklighetsbaserad data,
• utföra statistiska analyser för ärftlighet och kvantitativa egenskapslocus samt utföra genuttrycksanalyser och tolka resultaten.

Värderingsförmåga och förhållningssättEfter avslutad kurs förväntas studenten kunna:

• Kritiskt bedöma olika genomiska analyser och hur de kompletterar varandra, samt göra jämförelser mellan kvantitativa genetiska teknikers begränsningar.
• Diskutera och teoretisera kring fördelarna med särskilda aspekter av genidentifiering och hur de interagerar med varandra.

Innehåll

Kursen belyser hur fältet genetik har utvecklats från analys av egenskaper som kontrolleras av enstaka gener till analys av komplexa egenskaper och variation mellan individer som styrs av ett stort antal separata loci.

Kursen fokuserar på praktiska aspekter på komplexa egenskaper, framför allt statistiska metoder och hur de används i forskning och försöksdesign. Aspekter som ärftlighet, genkartläggning, transkriptomik, mutagenes, transgenes och komplexa sjukdomar kommer behandlas, liksom olika beteenden.

Studenten kommer att tillämpa kvantitativa genetiska tekniker på faktiska data, samt diskutera begränsningarna för sådana tekniker samt göra jämförelse emellan dem. De kvantitativa genetiska teknikerna bearbetas via statistikprogrammet R.